Patologi

Torill Sauer (gruppeleder)

Solveig Norheim Andersen

Glenny Cecilie Alfsen

Torill Sauer

Hanna Marie Eng

Ulla Randen

Christine Penz

Richard W. Doughty

Mette Kristin Pedersen

Sarita Joshi

Ann-Christin R Beitnes

Vi har et utstrakt samarbeid med flere avdelinger, miljøer og laboratorier på Akershus universitetssykehus, samt med andre sykehus og utdanningsinstitusjoner rundt om i Norge.

Vi har i tillegg en del samarbeid med medisinske miljøer ved UiO, og har pågående prosjekter med OsloMet.

Avdelingen deltar også i Infrastruktur for presisjonsdiagnostikk innen kreft (InPred), der vi analyserer prøver fra flere sykehus i Norge som en del av det nasjonale arbeidet med presisjonsmedisin.  

Tidlig deteksjon ved hjelp av ikke-invasive biomarkører og overvåkning av intestinal bakterieflora

Norge har en av de høyeste forekomstene av kolorektal kreft i verden. Tidlig oppdagelse av kolorektal kreft øker sjansen for vellykket behandling betydelig, med en femårsoverlevelse på over 90% for pasienter diagnostisert på et tidlig stadium. Det nasjonale screeningprogrammet for kolorektal kreft i Norge ble startet i 2022 og inviterer alle kvinner og menn til å delta i screening det året de fyller 55 år. Programmet benytter Fecal Immunochemical Test (FIT) for å avdekke usynlig blod i avføringen, og testen gjentas hvert annet år i ti år. Formålet med programmet er å oppdage kolorektal kreft tidlig for å forbedre behandlingsresultatene og redusere dødeligheten. FIT-screening har imidlertid flere svakheter, inkludert begrenset sensitivitet og molekylærbiologiske metoder som kan brukes som komplementære tester til FIT. Målet med vår forskning er å utvikle og kartlegge et panel av molekylære biomarkører som stammer fra genetiske, epigenetiske og immunologiske forandringer i tarmen ved tidlig oppdagelse av sykdommen. Samtidig har den mikrobielle floraen i tarmen fått økt oppmerksomhet i forbindelse med kolorektal kreft. Derfor studerer vi endringer i tarmens mikrobiota ved tidlig oppdagelse av kolorektal kreft. 

Prosjektet er et samarbeid mellom Ahus, Oslo Metropolitan University (OsloMet) og Universitet i Oslo (UiO).  

Prosjektet er tverrfaglig og bruker kunnskap og teknikker fra flere fagfelt inkludert patologi, molekylærbiologi, mikrobiologi, immunologi og bioinformatikk.

Resultater  

Gruppen har publisert flere fagfellevurderte artikler og hatt en doktorgradsavhandling. I samarbeid med OsloMet har gruppen veiledet seks masteroppgaver og tre grupper bachelorstudenter (12 bioingeniører). For tiden er det to PhD-kandidater som jobber innenfor ulike aspekter av prosjektet.

 Forskningsgruppen

For Ahus og OUS.

• Vahid Bemanian (PhD), prosjektleder og ansvarlig for prosjektets biobank, forsker  patologiavdelingen. 
• Ulla Randen (MD og PhD), leder patologiavdelingen og førsteamanuensis UiO. 
• John Christopher Noone (PhD), leder, molekylær patologi og forskning. 
• Jose Luis Subirats Camcho (MD, PhD-kandidat), patologiavdelingen.
• Per Christian Sæther (PhD), forsker, immunologi og transfusjonsmedisin. 
• Stephan Brackman (MD, PhD), gastroenterologi, Ahus og UiO. 
• Silje Mathiassen (MSc), forskningskoordinator, spesialbioingeniør molekylær patologi og forskning.
• Sofie Ranestad (MSc), spesialbioingeniør molekylær patologi og forskning.
• Thulasika Senthakumaran (PhD), forsker, mikrobiologi og smittevern.

For Oslo Metropolitan University (OsloMet):  

• Hege Smith Tunsjø (PhD, ass. Professor Biomedisin) 
• David Jahanlu (MD, PhD, Professor biomedisin)  
• Thura Omran (MSc, PhD-kandidat) 

Bruk av flytende biopsi i kreftdiagnostikk: Evaluering av neste generasjons sekvensering for oppfølging av lungekreftpasientene ved Akershus universitetssykehus

Prosjektets mål er å undersøke muligheten for å etablere en neste generasjons sekvensering (NGS) protokoll for rutinemessig overvåking av resistensvarianter i sirkulerende tumor DNA (ctDNA). Blodprøver tas fra en undergruppe av pasienter med avansert ikke-småcellet lungekreft (NSCLC) som gjennomgår behandling. Seksjon for molekylær patologi har samlet mye erfaring med å analysere ctDNA av NSCLC-pasienter ved bruk av en PCR-basert metode som oppdager varianter i Epidermal Growth Factor Receptor (EGFR) genet.  

Gjeldende retningslinjer for persontilpasset behandling av pasienter med NSCLC anbefaler testing for mutasjoner i flere onkogener, inkludert EGFR, ERBB2, ALK, ROS1, BRAF, KRAS, RET, NTRK og MET.  

Prosjektet vil være et samarbeid mellom Lungeavdelingen, og Avdeling for patologi. Overlege ved Lungeavdelingen Kirill Neumann og hans team vil være ansvarlig for utvelgelse av pasienter, deres behandling, samt innhenting av blodprøver. Ingeniører fra seksjon for molekylær patologi vil arbeide med å klargjøre plasmaprøver, ekstrahere prøvene og analysere de ved bruk av NGS-analyser.

Prosjektmedarbeidere

• Vahid Bemanian (PhD), forsker patologiavdelingen.
• John Christorfer Noone (PhD) leder molekylær patologi og forskning.
• Kirill Neumann (MD, PhD), lungeavdelingen.
• Sofie Ranestad (MSc), spesialbioingeniør ved molekylær patologi og forskning.

Patologiavdelingen, ved forsker Vahid Bemanian, samarbeider aktivt med forskningsgruppen CRCbiome (Kreftregisteret og UiO) ledet av Professor Trine Rounge.

Gruppens hovedmål er å identifisere mikrobielle biomarkører for påvisning av kolorektal kreft i tidlig stadium. Vi samarbeider med to prosjekter initiert av gruppen CRCbiome:

1. Understanding the longitudinal changes in and interplays between lifestyle, gut microbiome, lesion genome and epigenome during colorectal cancer development.
2. Evaluating microbial biomarkers for improved stool-based colorectal cancer screening.

Et viktig fokusområde for avdelingen er teknologisk utvikling, særlig med tanke på mulighetene kunstig intelligens gir innen fagfeltet patologi. Vi ser stort potensiale i KI for å styrke diagnostisk presisjon og effektivisere arbeidsprosesser. Derfor deltar vi i flere KI-relaterte forsknings- og utviklingsprosjekter, slik som i samarbeidet med forskningsgruppen Artificial Intelligence and digital pathology in CANcer (AICAN) ledet av førsteamanuensis i patologi ved NTNU Marit Valla. Gruppens hovedmål er å etablere metoder for å kunne forutsi kreft og dens egenskaper både i bryst- og i lungekreft ved hjelp av KI.

Vi har også et samarbeidsprosjekt med Ahus innovasjonssenter for KI om digitalisering av patologiske snitt for å kunne utvikle en KI-modell som skal predikere risiko for tilbakefall hos pasienter med brystkreft. Dette prosjektet er ledet av Jesper Ravn fra medisinsk teknologi og e-helse, og tar sikte på å forbedre dagens pasientbehandling og prognostisering.

• Snitting av FFPE blokker til histologi, immunhistokjemi og molekylære analyser.
• Evaluering av patolog (patologirapport, bekrefte diagnose, vurdere vevsrepresentativitet).
• Molekylære analyser: 
  • Neste generasjons sekvensering (NGS) (Oncomine Comprehensive Assay, Genexus Oncomine precision assay, Oncomine Comprehensive Assay Plus (fra høst og vinter 2025))
  • Prosigna
  • KRAS, NRAS, BRAF, MSI (Idylla)
  • EGFR (FFPE og cfDNA)
  • FISH (Break apart C-MYC, BCL2 og BCL6)
  • B- og T-celle klonalitetsanalyse
• Rutinefarging av vevssnitt:
  • HPS
  • HE
• Immunhistokjemi (liste over antistoffer ved forespørsel).

Har du spørmål eller ønsker samarbeid ta kontakt med oss.

Har du ønske om å skrive bachelor- eller masteroppgave hos oss, eller ønsker du som medisinstudent ved forskerlinjen å bli med i forskningsgruppen? Ta kontakt med oss, kanskje har vi en oppgave for deg!